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哈尔滨工程大学是以原哈军工的海军工程系为基础组建而成，原名哈尔滨船舶工程学院，所以其船舶工程国内领先，属于第一阵营院校。因其成立的较晚，并未赶上改革开放之前的重点院校评选，但是改革开放之后列入第一批重点高校之一，并且顺利进入工程行列。哈尔滨工程大学在潜艇方面实力超强，而潜艇最具威胁的是核潜艇，自然其核技术也相当强悍。核技术其实分支很多，应用范围也较多，但是目前随着我国核电的大力发展，多数学习此类专业毕业生，不是去教研单位，基本就去了核电企业。哈尔滨工程大学另外一个特色就是在哈军工原址办学，校园建筑中西合璧，飞檐碧瓦，气势恢宏。东北农业大学是以原东北大学的农学院为基础组建而成，后又合并多所北方高校的相关系科，建校之初的班底实力相对较强，而且建设标准也较高，起步就是本科院校。但是东北农业大学后来并入黑龙江省管理，这就使得其办学质量开始大幅下降。这主要是因为省管高校更注重招收本省考生，毕竟这类高校获得资金主要是来自省里，招生的弊病使得东北农业大学发展严重受限。国家在布局农大相对比较合理，基本覆盖了全国各类不同地区和地貌特点，东北农业大学是极寒农业的代表。但是早期东北地区的农业属于半年农业，也就是说半年农忙，半年农闲，这就使得这方面的教研积累相对薄弱。后来国家统一在海南实行育种基地制，使得这方面的条件有所改观。但是畜牧方面依旧没有得到有效改变，虽然东北农业大学畜牧实力较强，但针对东北地区的特色教研，还是比较落后。总体来看，哈尔滨工程大学的实力要高于东北农业大学，这主要是因为哈尔滨工程大学建校班底实力强，属于国防体系，投入和项目较多所致。


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